但是随着大量玉米因为托市收购流入到国储库，不仅推高了粮价，同时天量库存也加重了国家的财政负担，玉米临储政策弊端越来越明显。
前述人士表示，通过这次改革，形成市场价格形成机制，让市场活力得以恢复，农业种植质量提升起来，改革的最大社会效益是把去库存与农业结构性改革统筹结合起来。
今年3月份，国内玉米库存达到2.5亿吨，需要付出巨大的库存费用和利息费。之前，国务院发展研究中心研究员程国强在研究报告中指出，包括收购费、做囤费、保管费和资金利息等，每吨粮食库存成本在252元。据此计算，2.5亿吨玉米一年的库存费用理论上在630亿元。
在行业专家看来，之前的玉米临储托市收购政策，在粮食“保供给”与对农民“保收益”上，两个目标不加区分混合在一起，扭曲了国内的粮食价格市场形成机制。
之前，程国强就建议，通过“价补分离”，退出粮食政策的“保收益”功能，将其回归到“解决农民卖粮难”的政策设计初衷，通过退出价格支持政策，来消除对市场价格干预与影响，让市场形成价格机制。而对于确保农业稳定，可以通过直接补贴措施来“保收益”。
